Mūrinė totorių mečetė pastatyta 1930–1933 m.. Projekto autoriai architektai V. Michnevičius ir A. Netyksa. Projekto viršuje kairėje pusėje parašytas pirmas mečetės pavadinimas: „Kauno mečetės Lietuvos Didžiojo kunigaikščio Vytauto vardo“ projektas. Mūrinė mečetė buvo pastatyta Kauno totorių draugijos iniciatyva. Pastatas sumūrytas iš tuščiavidurių betono blokelių, viduje ir išorėje sienos tinkuotos. Perdangą laiko metalinės sijos. Pertvaros medinės, stogas dengtas skarda. Didžioji kupolo konstrukcija dviguba kiautinė. Pastatas nedidelis, grakščių proporcijų. Mečetės vidus buvo dekoruotas ornamentine tapyba, langai inkrustuoti įvairiaspalviu stiklu, portalo durys puoštos aštuoniakampio motyvais