Šalia mečetės buvo kapinių teritorija, kuri buvo pradėta naudoti apie 1850 m. Paskutinis totorius Motiejus Tuhan Baranauskas palaidotas 1946 m.. Kapinėse buvo palaiduoti šie totoriai musulmonai: Iljasevičių šeimos nariai, karys Mikalmanavičius, pulkininkas J. Kalina, pulkininkas D. Kalina, 1941 m. birželio sukilimo dalyvis A. (Aleksandras) Tuhan Baranauskas, Asanavičių šeimos nariai ir kiti. Musulmonų kapinės buvo aptvertos medine, o vėliau 1932 m. mūrine tvora. Kapinės panaikintos 1958 m.. Apie palaikų perlaidojimą duomenų nėra.
Kapinių teritorijoje apie 1960 m. buvo įrengtas fontanas. Šiuo metu įrengta vaikų žaidimo aikštelė.